En naviguant sur notre site vous acceptez l'installation et l'utilisation des cookies sur votre ordinateur. En savoir +

Menu Logo Principal Logo UNS Logo CNRS

Inra Sophia Antipolis : Formation et Recherche en Santé des Plantes

La Formation et la Recherche en Physiologie Végétale

Bioinformatique Appliquée : Analyses de séquences

Intitulé : Bioinformatique Appliquée : Analyses de séquences

Niveau / Semestre : L3-S6
Unité d’enseignement :
ECTS :
Responsable : R. Gautier

L - Licence ; S - Semestre ; UEO - unité d’enseignement optionnelle ; ECTS - European Credits Transfer System.

Objectif et contenu

Ce module a pour but d’initier les étudiants aux outils d’analyse de séquences biologiques disponibles sur Internet pour des applications en bioinformatique et biotechnologie.
Contenu : Structure et utilisation des grandes bases de données du domaine (EBI, NCBI, SwissProt); Les principaux outils de recherche dans les bases de données (SRS & Entrez); Compréhension et utilisation d’outils d'analyses de séquences nucléiques et protéiques, Notions d'alignements 2 à 2 et multiple (ClustalW) ; utilisation avancée de l'outil Blast ; Recherche de Motifs dans des séquences ; Recherche de primer, etc…

Compétences
  • scientifiques: Analyse des séquences biologiques : recherches d’informations, de similitudes, Recherches dans des banques de données biologiques par l’outil SRS, maitrise des outils d’alignement (Align, Blast), recherche de motifs, recherche d’amorces PCR.
  • transversales: Informatique (maitrise d’outils d’analyse bioinformatique), connaissances d’algorithmes pour la biologie (alignement de séquences), notion sur les bases de données, utilisation d’Internet

Intervenants de l’UE : C. Sabourault, R. Gautier, D. Colinet