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Inra Sophia Antipolis : Formation et Recherche en Santé des Plantes

La Formation et la Recherche en Physiologie Végétale

UE37 - Ecologie Moléculaire

Intitulé : Écologie Moléculaire
Niveau / Semestre : Master 1/2 - Semestre 1/3
Unité d’enseignement : UE optionnelle Spécialité PPAE et Spécialité GSP
Responsables : Didier Forcioli et Lorraine Bottin

M- Master ; S - Semestre ; UE - unité d’enseignement

Objectif :

Cette  UE  s'inscrit dans le cadre de l'étude de la structuration  de la diversité génétique en  terme de populations  et  de  l'effet  de  cette  structuration.  Elle  présente  les  méthodes  d'acquisition  et d'utilisation de marqueurs moléculaires de la diversité adaptés aux différents modèles biologiques, ainsi que les avantages et limites de leur utilisation. Elle forme les étudiants aux méthodes indirectes de mesures des flux géniques.

  • Recenser  les  marqueurs  moléculaires  de  la  diversité  génétique,  avec  leurs  avantages  et  limites (marqueurs  multilocus :  RAPD,  AFLP,  etc.. ;  marqueurs  monolocus :  SSCP/DDGE,  PCR  RFLP, Microsatellites,  EPICS,  SNP,  etc…);
  • Présenter  les  perspectives  liées  aux  nouvelles  techniques  de séquençage;
  • Présenter les modèles de mutation et les problèmes d’homoplasie;
  • Présenter les méthodes d’étude de la connectivité entre populations (indices de  fixation de Wright ou de partage de la diversité, approches Bayesiennes, etc…);
  • Appliquer ces méthodes à des études de phylogéographie.

Intervenants : D. Forcioli, L. Bottin, M. Poirié, intervenants extérieurs

Équipes de recherche associées :