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INRAE

URFM - UR629

Site Agroparc

Domaine Saint Paul

F-84914 AVIGNON Cedex 9

https://orcid.org/0000-0001-6891-7315https://cv.archives-ouvertes.fr/caroline-scotti-saintagne

https://www.researchgate.net/profile/Caroline_Scotti-Saintagne

Ingénieure de Recherche à l'Unité de Recherche Écologie des Forêts Méditerranéennes (URFM) rattachée au Departement Écologie et biodiversité (ECODIV).

Responsibilities :

Deputy Coordinator of IUFRO ((International Union of Forest Research Organizations) ) Division 2.02.13 - Breeding and genetic resources of Mediterranean conifers (since 2019)

General expertise :

I'm a geneticist of forest tree populations. My research projects focus on the characterization of genetic diversity (neutral and adaptive) in order to conserve local genetic resources and to test their adaptive capacity. I worked during ten years in Amazonian forest but since five years I am also interested in Mediterranean trees. I pay particular attention to the study of gene flows, whether between populations or between closely related species, with the aim to both preserve local genetic resources from hybridization or to promote adaptation through hybridization when local resources are no longer available. I have connections with forest management stakeholders (National Forestry Office (ONF), National Center for Forest Ownership (CRPF)), conservation organizations (Natura 2000).

Je suis généticienne des populations d'arbres forestiers. Mes projets de recherche se concentrent sur la caractérisation de la diversité génétique (neutre et adaptative) afin de conserver les ressources génétiques locales et de tester leur capacité d'adaptation. J'ai travaillé pendant dix ans en Guyane où j'ai étudié la forêt amazonienne, aujourd'hui je m'intéresse à la forêt méditerranéenne. J'accorde une attention particulière à l'étude des flux de gènes, que ce soit entre populations ou entre espèces étroitement apparentées, dans le but à la fois de préserver les ressources génétiques locales de l'hybridation ou de favoriser l'adaptation lorsque les ressources locales ne sont plus disponibles. J'ai des liens avec les acteurs de la gestion forestière (Office national des forêts (ONF), Centre national de la propriété forestière (CNPF), les organisations de conservation (Natura 2000, Conservatoire d'espaces naturels).

Positions académiques :

Activités de relectrice

Annals of Forest Science, Molecular Ecology, Annals of Botany, Annals of Applied Biology, Forest Ecology and management, Evolution Application, Heredity, Journal of Biogeography.

Coordination de projets

2023-2025 : projet « biodiversité de l’inter-Parc du Massif central » Opération « forêt ancienne volet 4" financé par l’association des Parcs naturels du massif central (IPAMAC). Je coordonne pour INRAE la mission d’accompagnement technique et méthodologique pour étudier la résilience des forêts face au changement climatique dans trois parcs naturels régionaux du Massif central (24000 euros).

2021-2025 : Appel à projets « Amélioration et valorisation des connaissances sur la biodiversité en Occitanie. Région Occitanie. Projet Occigen : Caractérisation de la capacité de résilience des forêts anciennes et des vieilles forêts d’Occitanie pour le maintien de la biodiversité : Approche génétique, écologique et écophysiologique. (budget 249 861 euros)

2020-2021 : Appel à projet financé par le réseau ECCOREV. Projet PERPLEX. Quel avenir pour nos forêts ? Quelles perceptions du public pour les espèces exotiques ? Approches rétrospectives et contemporaines dans les sapinières méditerranéennes. (budget 8000 euros)

2020 : financement par le Réseau Eccorev. Introduction d’espèces exotiques :  Quel avenir pour nos forêts ? Quelles perceptions par le public ?  Approches contemporaines et rétrospectives dans les sapinières méditerranéennes. (Perplex, 10000 euros). Partenariat avec LPED, IMBE, ONF, CRPF, DSF.

2019-2020 : Région Sud-PACA. Caractérisation, en conditions naturelles, de la reproduction sexuée du sapin autochtone (Abies alba) et du sapin de méditerranée (A. Cephalonica) en vue de mieux maîtriser l'hybridation interspécifique naturelle dans un contexte d'adaptation au changement climatique.” (RapiDAdap , budget 26128 euros)

2012 : Projet innovant INRA : Mise au point d’outils pour la reconnaissance des espèces sœurs (OUTIREC, budget : 9000 euros).

2012 : Projet financé par le labex CEBA : Délimitation des espèces inter-fertiles et reconstruction des scénarios de spéciation (DEFIS , budget 13500 euros).

2008-2010 : Programme Amazonie II : Rôle des variations climatiques et de la spécialisation écologique dans la distribution des espèces tropicales : Apport des approches génétiques (CLIPS, budget : 100 000 euros).

2006-2007 : Subvention du Ministère d’Outre-Mer (MOM, budget 18 000 euros) : Estimation et répartition géographique de la diversité génétique dans deux espèces du bassin amazonien (Carapa sp et Jacaranda) et estimation de la diversité génétique dans la collection d’amélioration génétique du poirier pays (Tabebuia heterophylla) en Guadeloupe

Collaborations dans des projets

2022-2027 :  Exploiter les ressources génétiques forestières pour accroître les options face aux défis environnementaux et sociétaux. Projet Européen OpFORESTS. Coordonné par González-Martínez (INRAE). https://www.optforests.eu/
Contribution : participation à la tache 4.3 Gestion à l'échelle régionale de la diversité génétique des arbres pour combiner résilience et services écosystémiques. Je coordonne la mise en place et l’analyse de l’impact de l’hybridation entre le pin de Salzmann sous-espèce de pin noir protégée endémique en France et des sous-espèces exotiques plantées à proximité d’aires protégées.

2022-2026 : Les flux de gènes à la rescousse : Nécessité, efficacité, risques et implications éthiques des manipulations de flux de gènes pour améliorer l’adaptation au changement -climatiques de plantes longévives – FloRes. Projet ANR coordonné par Ophélie Ronce (CNRS, ISEM) https://anr.fr/Projet-ANR-22-CE02-0010 
Contribution : Coordonne les mesures terrain, la mise en place d’un test de stress à la sécheresse en condition contrôlées (Pépinière ONF, PNRGF Cadarache) et les analyses génétiques du sapin pour estimer l’impact de l’hybridation inter-spécifique dans l’adaptation au changement climatique et la conservation de la biodiversité.
2021-2024 : Réseau Expérimental Forestier d’essences de diversification pour le renouvellement des forêts (REFER). Financeur : France bois Forêt. Coordination Alain Berthelot (FCBA). 
Contribution : Coordination des actions de terrain sur sapin, pin noir, pin pignon. Analyse des données. Rédaction des fiches synthétiques pour les dispositifs INRAE qui concernent ces trois espèces (18 dispositifs).

 
2023-2025 : Projet de rédaction d’un beau livre sur les vieilles forêts d’Occitanie. Financement : INRAE, Parc national des Cévennes, Parc national des Pyrénées, Fondation Agropolis, DRAC. Coordination : Frédéric Jean & Pascal Matthieu
Contribution : Recherche et montage des dossiers de financement. Membre du comité de rédaction.

2023-2025 : Projet de verger à graines de cormier financé par France bois forêt. Coordinateur : Philippe Proudhon ONF.
Contribution : Coordonne l’analyse génétique et la sélection des arbres à inclure dans le verger à graines

2023-2026 : Co3, Co construction des connaissances. Financement ADEME, Agropolis Fondation, Fondation Charles Léopold Mayer, Fondation Daniel & Nina Carasso, Fondation de France. Projet consolidé Cormier3R : Convergence Cormier - Réseau, Ressources et Résilience d'un arbre oublié au service de la transition agro-écologique. Coordination Marilyne Laurans (CIRAD) & Evelyne Moinet (Association Cormier sorbus domestica). Projet de science participative. https://amap.cirad.fr/fr/edit-projet.php?projet_id=279
Contribution : Coordonne l’action de l’analyse de la diversité génétique du cormier à l’échelle nationale.

2022-2023 : Co3, Co construction des connaissances appel à projets émergents. Financement ADEME, Agropolis Fondation, Fondation Charles Léopold Mayer, Fondation Daniel & Nina Carasso, Fondation de France.  Projet émergent Cormier3R : Convergence Cormier - Réseau, Ressources et Résilience d'un arbre oublié au service de la transition agro-écologique. Coordination Marilyne Laurans (CIRAD) & Evelyne Moinet (Association Cormier sorbus domestica). Projet de science participative.
Contribution : Participation à tous les ateliers et participation à la co-construction un projet de recherche basée sur les science participatives

2023-2025 : Patrimoine archéologique en Occitanie. Projet du défi-clé Science du passé. Projet Bosca : Archéologie et histoire de la production, du transport et des usages du bois en Occitanie depuis le Moyen Âge. Coordinateur Nicolas Poirier (CNRS, UMR 5608 Traces). Contribution : apporte l’expertise en écologie évolutive et participe à l’axe transversal sur la rédaction d’un beau livre sur les forêts occitanes dont je suis membre du comité de rédaction.

2022-2024 : Metaprogramme Biosefair INRAE, projet exploratoire. Projet Biofordiv diversité taxonomique, fonctionnelle et phylogénétique des biocénoses forestières le long d’un gradient de naturalité. Coordinatrice : Pilar Fernandez-Conradi & Thomas Boivin.
Contribution : Lien étroit avec le projet Occigen que je coordonne. Partenariat en commun et sites en communs.
2021-2022 : Fond de dotation Plantons pour l’avenir -programme « innover ». Mesure d’adaptation et vigueur des provenances de sapin de Bornmüller. Coordinateur Bruno Fady (INRAE). 

2018-2019 : Département EFPA INRAE projet pré-valo “Profilage génétique des sous espèces et variétés de pins noirs pour la gestion des espaces naturels endémiques au moyen d’un kit SSR” Coordinateur : Bruno Fady. Contribution : Analyse statistique et rédaction du rapport

2018-2019 : Ministère de l'économie et de la compétitivité espagnol. Biogeographical history (Cantabrian Mountains, Central System and Pyrenees): 18000 years on climate and anthropogenic changes on indicative forest species” (CSO2015-65216-C2-1-P). Coordinateur : Albert Pèlachs. Contribution : Analyse de la diversité génétique et reconstruction de l'histoire évolutive du sapin pectiné dans les Pyrénées espagnoles.

2017- 2020: Ministère de l'agriculture et de l'alimentation. Sécurisation de l’approvisionnement en matériel forestier de reproduction SECUR MFR. Coordinateur Luc Pâques. Contribution  : Analyse de la phénologie dans les tests de descendances (Saint Lambert) de sapin de céphalonie.

2017 : Ministère de l'agriculture, de l'alimentation et de la Forêt. Conservation et Sélection de Ressources Génétiques Forestières. Coordinateur A. Dowkiw. Contribution  : Analyse de la phénologie dans les tests de descendances (Saint Lambert) et de provenances (Escampats) de sapins de céphalonie. Caractérisation génétique des provenances de sapin.

2014-2017 : CNRS défis Enviromics projet AREA. Analyse de la Réponse Evolutive des Arbres forestiers tropicaux dans l'environnement, approche génomique et métabolomique. Rédaction de la lettre d’intention et co- rédaction du projet final. Coordinateur G. Genta-Jouve. Contribution  : Analyse de la divergence génétique dans le Symphonia.

2013-2016 : Labex CEBA projet Amazomics qui vise à étudier la génétique et la génomique écologique de l’adaptation dans les arbres tropicaux, coordinateur I. Scotti. Contribution  : responsable du genre Symphonia globulifera

2012-2015: ANR BIOADAPT FLAG « Génétique écologique des arbres forestiers : interactions entre flux de gènes et variabilité environnementale dans la détermination de l’adaptation locale et du potentiel d’adaptation », coordinateur, I. Scotti. Contribution : Analyse de la diversité génétique dans les gènes de Symphonia et Carapa et mise en évidence de la sélection divergente entre différents écotypes.

2012-2015 : Projet national espagnol “The assembly of African floras from lineages to populations : effects of historical climate changes and species ecology” AFFLORA. Contribution : caractérisation des processus évolutifs neutres et adaptatifs dans la divergence génétique entre les écotypes de Symphonia globulifera.

2008-2011 : FEDER ENERGIRAVI « Estimation de la richesse génétIque des ressources amazoniennes du vivant »  Coordinateur, I.Scotti. Contribution   Tester l’influence de la sélection et de l’histoire démographique dans la spécialisation écologique des espèces phylogénétiquement proches (complexe d’espèces).

2008-2010 : CNRS AMAZONIE II COUAC «Impact des occupations amérindiennes anciennes sur les propriétés des sols et la diversité des forêts de la frange côtière guyanaise » coordinateur, E.Dambrine. Contribution  : tester l’impact de l’occupation humaine sur la diversité génétique de quatre arbres communs de la forêt tropicale humide

2007-2010 : ANR Bridge : bridging Information on tree diversity in French Guiana and a test of ecological theories”. Coordinateur, J.Chave. Contribution  : estimation du niveau de diversité génétique intra et interspécifique dans cinq complexes d’espèces afin de tester la corrélation entre différenciation phénotypique et différenciation génétique.

2005-2009 : INCO Seedsource  Projet européen FP6-2002-INCO-DEV-1 “ Developing best practice for seed sourcing of planted and natural regeneration in the neotropics”. Coordinateur, S.Cavers. Contribution  : Phylogéographie comparée de trois espèces d’arbres tropicaux à l’échelle du bassin amazonien.

Formation des étudiants

Thèses

Alice Copie (2022-2025) : Je co-encadre depuis le 1er décembre 2022 la thèse d’Alice Copie (Université d’Aix-Marseille) «Prédire le fonctionnement et l'évolution de l'hybridation interspécifique dans le contexte du changement climatique». Le directeur de thèse est Ivan Scotti.  Alice est encadrée par moi-même sur le contexte général et l’analyse de génétique des populations, Nicolas Martin, pour la modélisation des processus écophysiologique en lien avec la réponse au climat et François Lefèvre pour la partie modélisation des processus évolutifs en lien avec la sylviculture. https://climae.hub.inrae.fr/rubriques-verticales2/nos-actions/theses/these-a-l-urfm-2022

Guia Giovanelli (2013-2016) : encadrement de proximité pour les analyses de données et la rédaction de la thèse. Histoire évolutive et diversité adaptative du pin noir, Pinus nigra Arn., à l'échelle de son aire de répartition. Université de Aix-Marseille (AMU). Directeur de thèse : Bruno Fady.

Alexandra Thinaut (2012-2014); Co-directrice, directeur de thèse I.Scotti . Ecole Doctorale UAG. Génétique écologique et génomique des évènements de divergence chez les complexes d’espèces en forêt tropicale humide.

Maxime Casalis (2008-2011) Co-directrice; directeur de thèse I.Scotti . Ecole Doctorale UAG. Etudes des processus évolutifs à l’origine du maintien des complexes d’espèces en forêt tropicale humide.

William Montaigne (2008-2011) Co-encadrement. Directeur de thèse I.Scotti. Ecole Doctorale UAG. Diversité et adaptation au milieu chez les arbres forestiers tropicaux : étude de la génétique de l’adaptation chez les Myristicacées .

Delphine Audigeos (2007-2010) Co-encadrement. Directeur de thèse I.Scotti. Ecole Doctorale UAG. Analyse de la diversité génétique quantitative et moléculaire dans le complexe d’espèces d’arbres tropicaux Eperua

Licences et Masters

Cano Matéo & Aurélien Riou (2023) Co-encadrement avec Bruno Fady. Licence. Université de Aix-Marseille. Etude de l’acclimatation de trois essences de sapins turques et de leur variabilité inter-provenances en France. Sciences du Vivant 

Steven Adjakidje (2023) Co-encadrement avec Pilar Fernandez.  Master 1 Ecole pratique des Hautes Etudes, Paris. Caractérisation des souches de champignons à l’origine du chancre dans la collection nationale de cormier.

André De Sousa Rodrigues (2022) Co-encadrement avec Bruno Fady. Master 2 (BEE, Université Paris-Saclay) Création d’une core collection des ressources génétiquesforestières du pin de Salzmann en France. https://hal.inrae.fr/hal-04403640/document

Jacques Francioly (2022) Master 1 Université de Perpignan.  Caractérisation de la variabilité morphologique du cormier dans la collection des ressources génétiques nationale. Rapport de 28 pages. https://hal.inrae.fr/hal-04403727v1/document

Astrid Tempestini (2009) Master 2 pro P&M Curie, Paris. Organisation de la diversité génétique à l’intérieur d’un complexe d’espèces d’arbres de la forêt amazonienne : le Symphonia

Judith Andrivot (2009) Master 2 pro P&M Curie, Paris. Etude du régime alimentaire du tapir (Tapirus terrestris) en Guyane par analyse moléculaire des restes végétaux contenus dans les fèces : étude de faisabilité. Co encadrement avec Cécile Richard-Hansen (ONCFS).

Luc Allard (2009) Master 2 STEE Bordeaux. Organisation de la diversité génétique et estimation des flux de gènes dans le complexe d’espèces des Carapa, un arbre commun de la forêt amazonienne.

Christine Le Mounier (2008) Master 2 pro P&M Curie, Paris. Organisation de la diversité génétique au niveau de séquences chloroplastiques dans l’espèce Simarouba amara à l’échelle du continent Sud-Américain. 35p

Maxime Casalis. (2007). Master 2 FAGE Nancy. Analyse de la distribution de la diversité génétique dans l’espèce Jacaranda copaia (Aublet) proposition d’un scénario historique. 20p.

Stéphanie Barthe (2008) Master 1 BGAE Montpellier. Organisation de la diversité génétique au niveau de loci microsatellites dans l’espèce Simarouba amara à l’échelle du continent Sud-Américain. 25p.

Caroline Duret (2006). Stage libre Transition Licence Master. Estimation de la diversité génétique dans le genre Carapa au niveau de la Guyane française.

Responsabilités administratives

Directrice Adjointe de l'unité de recherches écologie des forêts méditerranéennes (URFM)

Réseaux internationaux

Depuis 2020 : de la section 2.02.13 de l’IUFRO (International Union of Forest Research Organizations) section Amélioration et ressources génétiques des conifères méditerranéens.

Depuis 2018 : Membre du réseau international AFORGEN (Alpine forest genomics network,

Publications à destination des gestionnaires forestièrs ou pour la société

Scotti-Saintagne C & B. Fady 2024. Bouleversement climatique : Le rôle des arboretums. N°671. Jardins de France. https://www.jardinsdefrance.org/bouleversement-climatique-le-role-des-arboretums/

Perret S. Fady B., Ginisty C., Giovannelli G., Matz S., Philippe G., Roig A., Scotti-Saintagne C. 2021. Les pins laricio sont-ils tous égaux face à la maladie des bandes rouges ? Forêt-entreprise °259.p 33-41.

Caroline Scotti-Saintagne . 2021 Le sapin du futur viendra -il du Sud ? Forêts de France. N° 642 pXX dossier essence du futur.

Caroline Scotti-Saintagne. 2021. Les carnets du Ventoux. Parcours de femmes deuxième partie. N°111.

Caroline Scotti & Bruno Fady. Pin de Salzmann, une essence autochtone à privilégier dans les peuplements de moyennes montagnes des Cévennes.GREC-SUD & RECO, 2020, Adaptation du Parc national des Cévennes au changement climatique et à ses impacts, ouvrage collectif co-édité par l’Association pour l’innovation et la recherche au service du climat (AIR Climat) et le Réseau d'expertise sur les changements climatiques en Occitanie (RECO), 56 p. ISBN : 978-2-491380-00-7

Caroline Scotti-Saintagne & Ivan Scotti. Le Parc national des Cévennes et l’adaptation des forêts au changement climatique. GREC-SUD & RECO, 2020, Adaptation du Parc national des Cévennes au changement climatique et à ses impacts, ouvrage collectif co-édité par l’Association pour l’innovation et la recherche au service du climat (AIR Climat) et le Réseau d'expertise sur les changements climatiques en Occitanie (RECO), 56 p. ISBN : 978-2-491380-00-7

Scotti-Saintagne, C., Fady, B., Davi, H., Pichot, C., Jean, F., Roig, A., Lingrand, M., Vauthier, D., Rei, F., Turion, N., Gilg, O., Brahic, P., Musch, B., Giovannelli, G. (2019). Evolution, acclimatation et adaptation au changement climatique de quelques résineux méditerranéens. Presented at Réunion Département Santé des Forêts Bourgogne-Franche-Comté, Couchey, FRA (2019-09-26 - 2019-09-26).

Scotti-Saintagne, C., Fady, B., Rei, F., Vauthier, D., Gilg, O., Davi, H. (2019). Hybridation entre sapins méditerranéens et pectiné quels processus d’adaptation ? Quel avenir pour les anciens tests de comparaison de provenances ?. Presented at Quel avenir pour les anciens tests de provenances, Luc en Provence, FRA (2019-02-28 - 2019-02-28).

Scotti-Saintagne C. & Scotti I.. Devant l’inéluctable dépérissement de certaines espèces d’arbres, des chercheurs s’interrogent et étudient les capacités adaptatives des différentes essences. 2020. La Garance voyageuse n° 128.

Scotti-Saintagne, C. (2019). Evolution et adaptation au changement climatique chez les sapins méditerranéens. Mise en place d’un site d’étude sur le Mont Ventoux. Presented at Société botanique du Vaucluse, Chateauneuf de Gadagne, FRA (2019-12-09 - 2019-12-09). 24 p

Scotti-Saintagne, C. (2019). Liens entre biodiversité et changement climatique, exemple des forêts. Presented at Climat : la nature, source de solutions, Avignon, FRA (2019-04-09 - 2019-04-09). 23 p

2015 et 2017 : Animation d’ateliers pour l'association des petits débrouillards

2018 : Émission radiophonique de 30 minutes « des fermes et des hommes » sur radio Bartas sur le programme de conservation du pin de Salzmann. http://www.radiobartas.net/listing-category/des-fermes-et-des-arbres/

Scotti-Saintagne C., Fady B., Giovannelli G., Turion N. 2018. Le pin de Salzmann : une espèce à protéger. La Garance Voyageuse. N° 123.

Expertise en appui aux politiques publiques

Scotti-Saintagne C, Anne Roig, Nasradin Touhami, Bruno Fady. Expertise génétique pour l'identification taxonomique (au niveau sous espèce) de quatre cent cinquante arbres appartenant à l'espèce Pinus nigra Arnold dans la Vallée de Mialet (Gard). Expertise réalisée pour la communauté de communes des Cévennes du Mont Lozère, Natura 2000 Vallée du Gardon de Mialet.

Bruno Fady, Anne Roig, Caroline Scotti-Saintagne. Expertise génétique pour l'identification taxonomique (au niveau sous espèce) de quatre-vingt-quatre arbres appartenant à l'espèce Pinus nigra Arnold sur le territoire de la communauté de communes du Pays des Vans en Cévennes (Ardèche). 30 août 2022

Bruno Fady, Anne Roig, Caroline Scotti-Saintagne. Expertise génétique pour l'identification taxonomique (au niveau sous espèce) de vingt-huit arbres appartenant à l'espèce Pinus nigra Arnold dans les Hautes Vallées de la Cèze et du Luech.. [Other] INRAE URFM. 2021.

Bruno Fady, Anne Roig, Caroline Scotti-Saintagne. Expertise génétique pour l'identification taxonomique (au niveau sous espèce) de vingt arbres appartenant à l'espèce Pinus nigra Arnold dans la forêt communale de Banne (07).. [Autre] INRAE URFM. 2021.

Rapport

Fady Bruno & Caroline Scotti-Saintagne. Potentiel adaptatif du sapin de Bornmüller en France. INRAE. 2023

Publications scientifiques

2023

Scotti-Saintagne Caroline, A. de Sousa Rodrigues, A. Roig, B. Fady. 2023 A comprehensive strategy for the conservation of forest tree genetic diversity: an example with the protected Pinus nigra subsp. salzmannii (Dunal) Franco in France. Conservation Genetics, inPress, ⟨10.1007/s10592-023-01581-8⟩. ⟨hal-04301676⟩

Scotti Ivan, Hadrien Lalagüe, Sylvie Oddou-Muratorio, Rose Ruiz Daniels, Delphine Grivet, et al.. Common microgeographical selection patterns revealed in four European conifers.Molecular Ecology, 2023, 32 (2), pp.393- 411.⟨10.1111/mec.16750⟩.⟨hal-04060643⟩

Jean Frédéric, Hendrik Davi, Sylvie Oddou-Muratorio, Bruno Fady, Ivan Scotti, et al.. A 14-year series of leaf phenological data collected for European beech (Fagus sylvatica L.) and silver fir (Abies alba Mill.) from their geographic range margins in south[1]eastern France. Annals of Forest Science, 2023, 80 (1), pp.35. ⟨10.1186/s13595-023-01193-9⟩. ⟨hal-04230363⟩.

2022

Bruno Fady, Edoardo Esposito, Khaled Abulaila, Jelena Aleksic, Ricardo Alia, et al.. Forest Genetics Research in the Mediterranean Basin: Bibliometric Analysis, Knowledge Gaps, and Perspectives. Current Forestry Reports, 2022, ⟨10.1007/s40725-022-00169-8⟩. ⟨hal-03746104A.

2021

Scotti-Saintagne, C., Boivin, T., Suez, M., Musch, B., Scotti, I., & Fady, B. (2021). Signature of mid-Pleistocene lineages in the European silver fir (Abies alba Mill.) at its geographic distribution margin. Ecology and Evolution, 11.

Lingrand M., Scotti-Saintagne C., Oddou-Muratorio S., Correard M., Gilg O., Rei F., Roig A., Brahic P.. 2021. Evaluation de l’effet de la conservation du matériel végétal sur la quantité et la qualité de l’ADN, en vue de la mise en place d’une politique de gestion du stockage des échantillons. Les Cahiers des techniques de l'INRA, 2021. ⟨hal-03336843⟩.

2020

Tysklind, N, Etienne, M-P, Scotti-Saintagne, C, et al. 2020. Microgeographic local adaptation and ecotype distributions: The role of selective processes on early life-history traits in sympatric, ecologically divergent Symphonia populations. Ecol Evol. 2020; 00: 1– 19.

Binelli, G, Montaigne, W, Sabatier, D, Scotti‐Saintagne, C, Scotti, I. 2020 Discrepancies between genetic and ecological divergence patterns suggest a complex biogeographic history in a Neotropical genus. Ecol Evol.; 10: 4726– 4738. https://doi.org/10.1002/ece3.6227

Heuertz, M., Caron, H., Scotti-Saintagne, C., Pétronelli, P., Engel, J., Tysklind, N., et al. (2020). The hyperdominant tropical tree Eschweilera coriacea (Lecythidaceae) shows higher genetic heterogeneity than sympatric Eschweilera species in French Guiana. Plant Ecol. Evol. 153, 67–81. doi: 10.5091/plecevo.2020.1565

Olsson, S., Grivet, D., Cattonaro, F. et al. 2020 Evolutionary relevance of lineages in the European black pine (Pinus nigra) in the transcriptomic era. Tree Genetics & Genomes 16, 30 . https://doi.org/10.1007/s11295-020-1424-8

Ciminera, M. ;  Auger-Rozenberg, M-A;  Caron, H.;  Herrera, M.;  Scotti-Saintagne, C.;  Scotti, I;  Tysklind, N.;  Roques, A.. 2019. Genetic Variation and Differentiation of Hylesia metabus (Lepidoptera: Saturniidae): Moths of Public Health Importance in French Guiana and in Venezuela. Journal of Medical Entomology. 56 (1) 137-148. https://doi.org/10.1093/jme/tjy167

Caron, H.;  Molino, J-F.;  Sabatier, D.;  Leger, P.;  Chaumeil, P.;  Scotti-Saintagne, C.;  Frigerio, J.-M.;  Scotti, I.;  Franc, A.;  Petit, R. J. . 2019. Chloroplast DNA variation in a hyperdiverse tropical tree community. Ecol Evol. 2019; 9: 4897– 4905. https://doi.org/10.1002/ece3.5096

Scotti-Saintagne, C., Giovannelli, G., Scotti, I., Roig A., Spanu I., Vendramin, G.G., Guibal F., Fady B. 2019. Tree Genetics & Genomes 15: 76. https://doi.org/10.1007/s11295-019-1381-2

Torroba-Balmori MP, Budde KB, Heer K, González-Martínez SC, Scotti-Saintagne C, Dick CW, Heuertz M. 2017. Altitudinal gradients, biogeographic history and microhabitat adaptation affect fine-scale spatial genetic structure in African and Neotropical populations of an ancient tropical tree species. Plos one. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0182515

Barthe S., Binelli G., Herault B., Scotti-Saintagne C., Sabatier D., Scotti I., 2017. Tropical rainforests that persisted: inferences from the Quaternary demographic history of eight tree species in the Guiana shield. Molecular Ecology. Vol 26, issue 4

Olsson S, Seoane-Zonjic P, Bautista R, Claros MG, González-Martínez SC, Scotti I, Scotti-Saintagne C, Hardy OJ, Heuertz M. 2016. Development of genomic tools in a widespread tropical tree, Symphonia globulifera L.f.: a new low-coverage draft genome, SNP and SSR markers. Molecular Ecology Resources doi:10.1111/1755-0998.12605.

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Scotti-Saintagne C., Mariette S., Porth I., Goicoechea P-G., Barreneche T., Bodénès C., Burg K. Kremer A. 2004. Genome scanning for interspecific differentiation between two closely related oak species (Quercus robur L. and Q. petraea (Matt.) Liebl.). Genetics. 168 : 1615-1626.

Saintagne C., Bodénès C., Barreneche T., Pot D., Plomion C., Kremer A., 2004.Distribution of genomic regions differentiating oak species assessed by QTL detection. Heredity 92:20-30.

Scotti-Saintagne C., Bodénès C., Barreneche T., Bertocchi E., Plomion C., Kremer A.2004. Detection of quantitative trait loci controlling bud burst and height growth in Quercus robur L. Theoretical and Applied Genetics 109 : 1648:1659.

Storme V., Vanden Broeck A., Ivens B., Halfmaerten D., Van Slycken J., Castiglione S.,Grassi F., Fossati T., Cottrell J.E., Tabbener H.E., Lefèvre F., Saintagne C., Fluch S., Krystufek

V., Burg K., Bordács S., Borovics A., Gebhardt K., Vornam B., Pohl A., Alba N., Agúndez D.,Maestro C., Notivol E., Bovenschen J., van Dam B.C., van der Schoot J., Vosman B., Boerjan W., Smulders M.J.M.. 2004. Ex-situ conservation of Black poplar in Europe: genetic diversity in nine gene bank collections and their value for nature development. Theoretical and Applied Genetics 108(6):969-981. 2. Ouvrage collectif

Freville, F., Scotti-Saintagne C. 2010. Rôle des variations climatiques passées et de la spécialisation écologique dans la distribution des espèces tropicales ; apport des approches génétiques. pp108-111. Dans : Amazonie, une aventure scientifique et humaine du CNRS. Pavé A. et Fornet G. Editions Galaade.

Poster

Frédéric Jean, Caroline Scotti-Saintagne, Bruno Fady, Hendrik Davi. Long-term monitoring of leaf phenology for two forest tree species located at their hot and dry, southern margin. PHENOLOGY 2022 - Phenology at the crossroads, Jun 2022, Avignon, France. ⟨hal-03887777⟩

Valentin Journé, Frederic Jean, Caroline Scotti-Saintagne, Hendrik Davi. Modéliser les réponses des écosystèmes forestiers au changement climatique pour bien anticiper les conséquences. 25 ans du RENECOFOR , Oct 2017, Beaune, France. 2017

Audigeos D, Bonal D, Brousseau L, Scotti I, Scotti-Saintagne C . 2009. Selection in the tropical rain? Gene-level and trait-level divergence within a population of trees. ESEB meeting, Turin.

Tempestini A., Caron H., Casalis M., Scotti I., Scotti-Saintagne C. 2009. How adaptation and history contribute to the accumulation of genetic differentiation in the Symphonia species complex in French Guiana. 2009. International conference “Knowledge-based management of tropical rainforests” Cayenne 22-28 november, France.

Audigeos D., Brousseau L., Scotti-Saintagne C. Scotti I. 2009. Genetic diversity analysis in two tropical tree species of the genus Eperua. International conference “Knowledge-based management of tropical rainforests” Cayenne 22-28 november, France

Allard, L. Caron H., Guichoux E., Duret C., Casalis M., Scotti I., Scotti-Saintagne C. 2009. Effect of history on the genetic organization in the Carapa species complex in French Guiana. International conference “Knowledge-based management of tropical rainforests” Cayenne 22-28 november, France.Illustration de

Rinaldo R., Stien D., Beauchêne J., Scotti-Saintagne C., Molino J.F. 2009. By another way to identify Lauraceae for fragrances. International conference “Knowledge-based management of tropical rainforests” Cayenne 22-28 november, France.

Andrivot J., Scotti-Saintagne C., Hibert F., Caron H., Richard-Hansen C. 2009. From faeces to DNA: Characterization of the lowland tapir’s diet with genetic tools. International conference “Knowledge-based management of tropical rainforests” Cayenne 22-28 november, France

 Communications orales

2023

Scotti-Saintagne C, Bruno Fady & Consortium Occigen. Conservation of relict and mature forests: towards an integrative approach including genetic diversity. 4th Mediterranean Plant Conservation week. Valencia. 23-27 october 2023.

Scotti-Saintagne C & Bruno Fady. Conservation de la diversité génétique à l’heure du changement climatique: stratégie pour un conifère rare et menacé en Frane, le pin de Salzmann. Séminaire RARE. Paris le 20 septembre 2023.

Scotti-Saintagne C, B. Algoet, T. Boivin, W. Brunetto, M. Cailleret, C. Drénou, B. Fady ; P. Fernandez, O. Gilg, N. Gouix, G. Granget, F. Jean, L. Larrieu, F. Lefèvre, N. Martin-Saint-Paul, V. Marsaudon, M. Parizat, M. Pringarbe, A. Roig, G. Sajdak, JM.Savoie, I. Scotti, N. Turion, N. Touhami. Caractérisation de la capacité de résilience des forêts anciennes et des vieilles forêts par des approches de génétique, écologique et écophysiologique. Colloque SanteEcofor . Paris, 12 mars 2023.

Scotti-Saintagne C. Le pin de Salzmann une essence d’avenir à protéger. Saint étienne Vallée Française.19 juin 2023. Conférence débat: Pin de Salzmann, forêt cévenole et changement climatique.

2022

Caroline Scotti-Saintagne. Les connaissances en génétique évolutive et leur application pour la conservation et la gestion de la diversité génétique. La génétique évolutive au service de la gestion et de la conservation des forêts. Formation : ONF - FNE - SEPANSO, Mar 2022, Pierroton, France. ⟨hal-03681623⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Frédéric Jean. OCCIGEN - Caractérisation de la capacité de résilience des forêts anciennes et des vieilles forêts d’Occitanie : Approche génétique, écologique et écophysiologique. Journée d’échanges autour des programmes de recherche menés à la Réserve Naturelle de la Forêt de la Massane, Mar 2022, Visioconférence, France. ⟨hal-03681655⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Francois Lefèvre. Diversité génétique et gestion forestière au service de la forêt dans un contexte de changements globaux. Préservation de la diversité génétique, Feb 2022, Montels-PNR des Pyrénées ariégeoises-, France. ⟨hal-03681692⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Francois Lefèvre, Eric E. Collin. Conservation des ressources génétiques forestières. La génétique évolutive au service de la gestion et de la conservation des forêts. Formation : ONF - FNE - SEPANSO, Mar 2022, Pierroton, France. ⟨hal-03681611⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Jean Thévenet, Frédéric Jean. La génétique du Cormier (sorbus domestica). Conférence grand public dans le cadre du projet de science participative Cormier 3R : Convergence Cormier - Réseau, Ressources et Résilience d'un arbre oublié au service de la transition agro-écologique, Association Au pays d'en haut, Nov 2022, Lavaur, France. ⟨hal-03950981⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Bruno Fady. Connaissance sur la diversité génétique du pin de Salzmann ( Pinus nigra subsp. salzmannii) en France. 2022. ⟨hal-03951044⟩

Caroline Scotti-Saintagne, Ivan Scotti. interview pour le magazine Epsiloon. N°11. Les vieux arbres sont les gardiens des forêts. 2022. ⟨hal-03951032⟩

Caroline Scotti-Saintagne. interview audio de Valérie Greffoz. Epsiloon. Les vieux arbres sont les gardiens de la forêt. 2022. ⟨hal-03951025⟩

2021

-Caroline Scotti-Saintagne 2021. Prise en compte de la diversité génétique dans la sylviculture et la gestion durable des forêts. Pourquoi ? Comment ? Forum Adaptation des forêts du Vercors au changement climatiques. Lans en Vercors Le Cairn, vendredi 15 octobre 2021.

-Caroline Scotti. 2021. The Mediterranean forest in the face of global changes. Exposé en français. Congrès UICN. le mercredi 8 septembre, Marseille.https://www.iucncongress2020.org/fr/programme/speakers/caroline-scotti

-Bruno Fady, Caroline Scotti, A Roig, M.Lingrand, N. Touhami, N Turion, O. Gilg, F. Rei, M. Pringarbe, P Brahic, J. Reilhan, M. de Castro. 2021.  Bilan et perspectives pour la collection nationale de pin de Salzmann. Commission des ressources génétiques forestières. 21 septembre. Visioconference.

-Caroline Scotti, S. Girard, J., Thévenet, J. Reilhan, P.Brahic, M. de Castro, M. Rondoin, A. Roig, M. Lingrand, S. Muratorio. 2021. Conservation des ressources génétiques du cormier (Sorbus domestica L.). Commission des ressources génétiques forestières. 21 septembre. 41 diapos Visioconférence.

-Bruno Fady, Caroline Scotti-Saintagne. 2021. Le pin noir et ses sous-espèces. Histoire évolutive, variabilité morphologique, diversité génétique, exigence écologique, comparaison de la performance des sous-espèces. Seminaire pour le réseau des observateurs du DSF. 27 avril, visioconférence.

-Caroline Scotti-Saintagne 2021. Evolution, acclimatation et adaptation au changement climatique des sapins euro-méditerranéens. Conférence pour les observateurs du DSF. 18 mai 2021 visioconférence. 37 diapos.

Fady, B., Boivin, T., Musch, b., Scotti, I., Suez, M., Scotti-Saintagne, C. (2018). Demographic history of Abies alba Mill. in the French Pyrenees . Presented at Conférence Vulpes Rabat, Rabat, MAR (2018-10-01 – 2018-10-05).

Scotti-Saintagne, C. (2018). Différentes échelles de structuration dans l'espace des adaptations locales. Presented at Adaptation des forêts au changement climatique (Académie de l'agriculture), Paris, FRA (2018-10-03 - 2018-10-03). 18 p.

Scotti-saintagne, C., Boivin, T., musch, b., Fady, B., Scotti, I. (2018). Demographic and evolutionary history of Abies alba in the pyrenees. Presented at Réunion du groupe AFORGEN, Kranjska Gora, SVN (2018-06-21 - 2018-06-23). 15 p.

Heuertz, M., Jehanne, Q., Budde, K. B., Caron, H., Tysklind, N., Scotti-Saintagne, C., Guichoux, E., Molino, J.-F., Sabatier, D., El Mutjar, V., Franc, A., Garnier-Géré, P., Mariette, S. (2018). Evolutionary history of tropical tree species complexes: species delimitation and adaptive genetic variation in the Brazil nut clade (Lecythidaceae). In: Challenges in tropical ecology and conservation, global perspectives (p. 119). Presented at European Conference of Tropical Ecology (GTOE2018), Paris, FRA (2018-03-26 - 2018-03-29). 393

Heuertz, M., Jehanne, Q., Budde, K. B., Caron, H., Tysklind, N., Scotti-Santagne, C., Guichoux, E., Molino, J.-F., Sabatier, D., El Mujtar, V., Franc, A., Garnier-Gere, P., Mariette, S. (2018). Evolutionary history of tropical tree species complexes: species delimitation and adaptive genetic variation in the Brazil nut clade (Lecythidaceae). Presented at 2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), Montpellier, FRA (2018-08-19 – 2018-08-22).

Giovannelli, G., Scotti-Saintagne, C., Scotti, I., Roig, A., Spanu, I., Vendramin, G. G., Guibal, F., Fady, B. (2018). Demographic and evolutionary history of the European black pine (Pinus nigra Arn). Presented at Réunion du groupe AFORGEN, Kranjska Gora, SVN (2018-06-21 - 2018-06-23).

Giovannelli, G., Scotti-Saintagne, C., Fady, B. (2018). Histoire évolutive, diversité génétique et risques d’hybridation chez le pin de Salzmann (P. nigra salzmanni) . Presented at Pin de Salzmann, Banne, FRA (2017-12-07 - 2017-12-08). 32 p.

Giovannelli G., Scotti-Saintagne C., Lefèvre F., Davi H., Roig A., Vendramin G.G., Spanu I., Guibal F., Fady B., 2017. Evolutionary history and range-wide adaptive diversity in the European black pine, Pinus nigra Arn. IUFRO 125th Anniversary Congress, Freiburg, Germany. Session 153: Genetics and Genomics for Conservation, Climate Adaptation and Sustainable Management of Forests – Sept 18,.

Scotti-Saintagne, C. (Auteur de correspondance) (2017). Petite synthèse sur le sapin : son histoire démographique, sa capacité d'adaptation à réagir aux variations environnementales, des pistes pour sa gestion future. Presented at Séminaire hebdomadaire, Avignon, FRA (2017-06-12 - 2017-06-12). 46 p.

Heuertz, M., Jehanne, Q., Budde, K. B., Caron, H., El Mutjar, V., Franc, A., Garnier-Géré, P., Guichoux, E., Scotti-Saintagne, C., Molino, J.-F., Sabatier, D., Mariette, S. (2017). Hybridization and patterns of adaptive genetic variation in tropical trees of the Bertholletia clade (Lecythidaceae) in French Guiana. Presented at Meeting of the German Society for Tropical Ecology (GTOE2017), Bruxelles, BEL (2017-02-06 - 2017-02-10).

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Heuertz, M., Olsson, S., Torroba-Balmori, P., Rakotonandrasana, S., Rakotondrafara, A., Beatrix, M., Caron, H., Scotti-Saintagne, C., Mariette, S., Franc, A., Jehanne, Q., Sanmartín, I. (2016). Hybridization and the evolution of tropical tree species. Presented at ATBC Annual Meeting, Montpellier, FRA (2016-06-19 - 2016-06-23).

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Hibert F., Andrivot J., Chave J., Gonzalez S., Grenand P., Scotti-Saintagne C., Prévost M.F., SabatierD., Richard-Hansen C. 2010. Regards croisés sur l’alimentation du tapir en Guyane française.Conférence internationale IX CIMFAUNE 10-15 mai 2010, Santa Cruz Bolivie