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5 - Variabilité génétique des populations et des espèces à l’échelle du bassin Méditerranéen

Le concept de biodiversité intègre les différentes échelles de la diversité biologique : la diversité entre espèces, la diversité des populations au sein de chaque espèce, la diversité entre individus d'une même population, mais aussi la diversité des gènes que chaque arbre peut transmettre à ses descendants au fil des générations. Les ressources génétiques concernent plus particulièrement la diversité génétique, des populations aux gènes. Du fait des mécanismes de l'hérédité, les ressources génétiques sont naturellement en perpétuelle évolution. Qu'elles soient naturelles ou artificielles, les perturbations écologiques (par exemple les incendies, les changements climatiques, ou l'aménagement forestier) influencent les processus de cette évolution.

L'exploitation des ressources génétiques forestières va du simple choix des sources de graines pour le reboisement à la création variétale. La conservation des ressources génétiques vise à maintenir la capacité d'adaptation des espèces et des populations aux changements de leur environnement. Pour des espèces d'intérêt économique majeur, les programmes d'amélioration génétique à long terme intègrent ces deux volets : exploitation et conservation. Pour certaines ressources menacées, des programmes de conservation spécifiques sont engagés. Enfin, pour la plupart des espèces qui ne bénéficient pas de programmes spécifiques, ce sont les pratiques courantes de gestion des espaces qui doivent assurer le maintien et la disponibilité des ressources génétiques.

Dans ce contexte, nous développons notamment des recherches sur la diversité génétique d’arbres forestiers méditerranéens (Pin de Salzmann, Sapin méditerranéens), en relation avec leur environnement biotique et abiotique. Nous sommes plus généralement largement impliqués dans ces questions via notre notre contribution à la Commission des Ressources Génétiques Forestières, et la coordination de différents projets en lien avec les ressources génétiques forestières (INFORMED, GENTREE)

Projet : Salzman, INFORMED, GENTREE

Quelques publications :

Alfaro, R. I., Fady, B., Vendramin, G. G., Dawson, I. K., Fleming, R. A., Saenz-Romero, C., Lindig-Cisneros, R. A., Murdock, T., Vinceti, B., Navarro, C. M., Skrøppa, T., Baldinelli, G., El-Kassaby, Y. A., Loo, J. (2014). The role of forest genetic resources in responding to biotic and abiotic factors in the context of anthropogenic climate change. Forest Ecology and Management, 333, 76-87. DOI : 10.1016/j.foreco.2014.04.006 http://prodinra.inra.fr/record/287092

Awad, L., Fady, B., Khater, C., Roig, A., Cheddadi, R. (2014). Genetic structure and diversity of the endangered fir tree of Lebanon (Abies cilicica Carr.) : implications for conservation. Plos One, 9 (2), e90086. DOI : 10.1371/journal.pone.0090086. http://prodinra.inra.fr/record/255028

Conord, C., Gurevitch, J., Fady, B. (2012). Large-scale longitudinal gradients of genetic diversity : a meta-analysis across six phyla in the Mediterranean basin. Ecology and evolution, 2 (10), 2595-2609. DOI : 10.1002/ece3.350 http://prodinra.inra.fr/record/270032

Fady, B., Cottrell, J., Ackzell, L., Alía, R., Muys, B., Prada, A., González-Martínez, S. C. (2016). Forests and global change: what can genetics contribute to the major forest management and policy challenges of the twenty-first century?. Regional Environmental Change, 16 (4), 927-939. DOI : 10.1007/s10113-015-0843-9  http://prodinra.inra.fr/record/323414

Fady, B., Aravanopoulos, F. A., Alizoti, P., Mátyás, C., von Wühlisch, G., Westergren, M., Belletti, P., Cvjetkovic, B., Ducci, F., Huber, G., Kelleher, C. T., Khaldi, A., Kharrat, M. B. D., Kraigher, H., Kramer, K., Mühlethaler, U., Peric, S., Perry, A., Rousi, M., Sbay, H., Stojnic, S., Tijardovic, M., Tsvetkov, I., Varela, M. C., Vendramin, G. G., Zlatanov, T. (2016). Evolution-based approach needed for the conservation and silviculture of peripheral forest tree populations. Forest Ecology and Management, 375,66-75. DOI : 10.1016/j.foreco.2016.05.015. https://link.springer.com/article/10.1007/s10113-015-0843-9

Fady, B. (2012). Biogeography of neutral genes and recent evolutionary history of pines in theMediterranean Basin. Annals of Forest Science, 69 (4), 421 - 428. DOI : 10.1007/s13595-012-0219-y http://prodinra.inra.fr/record/214938

Koskela, J., Lefèvre, F., Schueler, S., Kraigher, H., Olrik, D. C., Hubert, J., Longauer, R., Bozzano, M., Yrjänä, L., Alizoti, P., Rotach, P., Vietto, L., Bordács, S., Myking, T., Eysteinsson, T., Souvannavong, O., Fady, B., De Cuyper, B., Heinze, B., von Wühlisch, G., Ducousso, A., Ditlevsen, B. (2013). Translating conservation genetics into management. pan-European minimum requirements for dynamic conservation units of forest tree genetic diversity. Biological Conservation, 157, 39-49. DOI : 10.1016/j.biocon.2012.07.023 http://prodinra.inra.fr/record/172258

Lefèvre, F., Koskela, J., Hubert, J., Kraigher, H., Longauer, R., Olrik, D. C., Schueler, S.,Bozzano, M., Alizoti, P., Bakys, R., Baldwin, Ballian, D., Black-Samuelsson, S., Bednarova, Bordacs, S.,Collin, E., De Cuyper, B., De Vries, S. M. G., et al. (2013). Dynamic Conservation of Forest Genetic Resources in 33 European Countries. Conservation Biology, 27 (2), 373 - 384. DOI : 10.1111/j.1523- 1739.2012.01961.x. http://prodinra.inra.fr/record/209080

Schueler, S., Falk, W., Koskela, J., Lefèvre, F., Bozzano, M., Hubert, J., Kraigher, H., Longauer, R., Olrik, D. C. (2014). Vulnerability of dynamic genetic conservation units of forest trees in Europe to climate change. Global Change Biology, 20 (5), 1498-1511. DOI :10.1111/gcb.12476 .http://prodinra.inra.fr/record/264072