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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal Unité de pathologie végétale - Inra Avignon

Pathologie végétale

Zone de texte éditable et éditée et rééditée

MORRIS Cindy

Directrice de recherche, Animatrice de l'équipe MISTRAL

CONTACT/PROFIL

 ACTIVITES DE RECHERCHE

  • Ma recherche porte sur l'écologie bactérienne. Mon équipe cherche à comprendre comment l'adaptation des bactéries à leur environnement affecte deux phénomènes apparemment contradictoires sur l'environnement, leur capacité à :
    • causer des maladies, et en particulier des maladies émergentes,
    • jouer des rôles bénéfiques dans les grands phénomènes environnementaux.
  • Notre travail est focalisé sur la bactérie Pseudomonas syringae. C'est un agent pathogène récurrent sur un large éventail de cultures d'importance majeure. Cette bactérie est aussi l'une des plus des actives, comme agent glacogène naturellement présent dans l'environnement. Son activité de nucléation de la glace - à des températures plus chaudes que la plupart des autres noyaux glacogènes - et sa capacité à monter dans les nuages via les courants d'air ont entrainé un grand intérêt dans son rôle éventuel dans les processus atmosphériques à l'origine de la pluviométrie.

Les pathogènes des plantes peuvent être hébergés dans des habitats agricoles et non agricoles et peuvent migrer entre ces différents types d'habitats. Ils peuvent également avoir des caractères utiles à leur adaptation à ces différents habitats ce qui peut les conduire à être impliqués dans divers phénomènes environnementaux. Pour la bactérie Pseudomonas syringae, nous étudions l'influence des habitats environnementaux sur l'émergence des maladies des plantes. Nous étudions également la dissémination de P. syringae via le cycle de l'eau et son influence sur les processus atmosphériques qui affectent les précipitations et la foudre.

  • Un des objectifs à long terme de notre travail est d'anticiper les échanges de souches pathogènes de P. syringae issues de réservoirs environnementaux avec les cultures et d'identifier les conditions les plus favorables pour l'émergence des maladies. Pour atteindre cet objectif, nous
    • identifier les réservoirs écologiques naturelles de P. syringae
    • déterminer le rôle de ces réservoirs dans l'évolution bactérienne
    • évaluer la probabilité de dissémination aux plantes cultivées
    • identifier les facteurs climatiques les plus favorables à la maladie.
  • L'autre objectif à long terme de notre travail est de définir des stratégies de gestion du paysage et des politiques qui concilient les deux rôles de micro-organismes, pathogènes pour les végétaux et bénéfiques pour les précipitations. Pour atteindre cet objectif, nous devons    
    • identifier les sources de microorganismes actifs glacogènes, qui sont aussi des agents pathogènes des plante
    •  évaluer le flux de ces microorganismes de la litière vers l'atmosphère
    • contribuer à la recherche sur le rôle des microorganismes dans la physique des nuages, y compris les processus liés à la pluviométrie, la foudre et de l'albédo
    • évaluer et cartographier l'intensité des réactions terre-atmosphère liées aux microorganismes.

SELECTION DE PUBLICATIONS

Pour une liste complète et plus récente, consultez ProdInra, l'archive ouverte de l'Inra

  • Morris C.E., Lamichhane J.R., Nikolić, I., Stanković S., Moury B. 2019. The overlapping continuum of host range among strains in the Pseudomonas syringae complex. BMC Phytopathology Research 1 :4 doi.org/10.1186/s42483-018-0010-6 https://prodinra.inra.fr/record/449078
  • Morris C.E., Moury B. 2019. Revisiting the concept of host range of plant pathogens. Annu. Rev. Phytopathol. 57:63-90. https://prodinra.inra.fr/record/471221
  • Omrani M., Roth M., Roch G., Blanc A., Morris C.E., Audergon J.M. 2019. Genome-wide association multi-locus and multi-variate linear mixed models reveal two linked loci with major effects on partial resistance of apricot to bacterial canker. BMC Plant Biol. 19 :31 doi.org/10.1186/s12870-019-1631-3 https://prodinra.inra.fr/record/458140
  • Parisi L., Morgaint B., Blanco Garcia J., Guilbaud, C., Chandeysson C., Bourgeay J.-F., Moronvalle A., Bru, L., Brachet M. L., Morris C.E.  2019. Bacteria from four phylogroups of the Pseudomonas syringae complex can cause bacterial canker of apricot. Plant Pathology 68 :1249–1258. DOI : 10.1111/ppa.13051 https://prodinra.inra.fr/record/472089
  • Morris C.E. 2018. Phytobiomes contribute to climate processes that regulate temperature, wind, cloud cover and precipitation. Phytobiomes 2:55-6 1 https://prodinra.inra.fr/record/427555
  • Leyronas C., Morris C.E., Choufani M., Soubeyrand S. 2018. Assessing the aerial interconnectivity of distant reservoirs of Sclerotinia sclerotiorum. Frontiers in Microbiology, section Extreme Microbiology 9 : doi.org/10.3389/fmicb.2018.02257 https://prodinra.inra.fr/record/443523
  • Bardin M., Leyronas C., Troulet C., Morris C.E. 2018. Striking similarities between Botrytis cinerea from non-agricultural and from agricultural habitats. Frontiers in Plant Science, 5 Dec 2018, doi.org/10.3389/fpls.2018.0182  https://prodinra.inra.fr/record/454055
  • Carotenuto F., Georgiadis T., Gioli B., Leyronas C., Morris C. E., Nardino M., Wohlfahrt G., Miglietta F. 2017 Measurements and modeling of surface–atmosphere exchange of microorganisms in Mediterranean grassland. Atmos. Chem. Phys. 17, 14919-14936, doi.org/10.5194/acp-17-14919-2017 https://prodinra.inra.fr/record/397803
  • Stopelli E., Conen F., Guilbaud C., Zopfi J., Alewell C., Morris C.E. 2017. Ice nucleators, bacterial cells and Pseudomonas syringae in precipitation at Jungfraujoch. Biogeosciences 14:1189-1196 https://prodinra.inra.fr/record/388708
  • Morris C.E., Soubeyrand S., Bigg E.K., Creamean J.M., Sands D.C. 2017. Mapping rainfall feedback to reveal the potential sensitivity of precipitation to biological aerosols. Bull. Amer. Meteorol. Soc. doi.org/10.1175/BAMS-D-15-00293.1  (June 2017:1109-1118) https://prodinra.inra.fr/record/371729
  • Monteil C.L., Yahara K., Studholme D.J., Mageiros L., Méric G., Swingle B., Morris C.E., Vinatzer, B.A., Sheppard S.K. 2016. Population genomic insights into the emergence, crop-adaptation, and dissemination of Pseudomonas syringae pathogens. Microbial Genomics doi: 10.1099/mgen.0.000089 https://prodinra.inra.fr/record/385934
  • Morris C.E., Monteil C.L., Berge O. 2013. The life history of Pseudomonas syringae: linking agriculture to Earth system processes. Annu. Rev. Phytopath. 51:85-104. https://prodinra.inra.fr/record/213942 

 PUBLICATIONS TRÈS CITÉES

Christner B.C., Morris C.E., Foreman C.M., Cai, R., Sands D.C. 2008. Ubiquity of biological ice nucleators in snowfall. Science 319:1214. https://prodinra.inra.fr/record/20734

Morris C.E., Monier J.-M. 2003. The ecological significance of biofilm formation by plant-associated bacteria. Annu. Rev. Phytopathol. 41:429-453. https://prodinra.inra.fr/record/67794

Morris C.E., Sands D.C., Vinatzer B.A., Glaux C., Guilbaud C., Buffière A., Yan S., Dominguez H., Thompson B. 2008. The life history of the plant pathogen Pseudomonas syringae is linked to the water cycle. The ISME Journal, 2:321-334.https://prodinra.inra.fr/record/22204

Ellison D., Morris C.E., Locatelli B., Sheil D., Cohen J., Murdiyarso D., Gutierrez V., van Noordwijk M., Creed I.F., Pokorny J., Gaveau D., Spracklen D., Bargués Tobella A., Ilstedt U., Teuling R., Gebrehiwot S.G., Sands D.C., Muys B., Verbist B., Springgay E., Sugandi Y., Sullivan C. 2017. Trees, forests and water: cool insights for a hot world. Global Environ. Change. 43 :51-61. https://prodinra.inra.fr/record/387537

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